1.防伪标识本身的技术含量低

　　数码防伪的标识物是防伪编码的载体，防伪编码是通过标识物标识在产品上。标识物本身防伪功能非常有限,目前市场上大多数数码防伪标签本身容易被伪造，而且防伪标签并不精美，不适合作为包装要求精美的产品贴标。

　　2.查询率低

　　查询率低是目前数码防伪普遍存在的问题。主要原因有３点：一是数码防伪是新生事物，许多消费者并不清楚如何通过查询鉴别真伪；二是商场、商店未提供查询工具，即查询不方便；三是查询成本过高。有些防伪公司利用声讯台作为消费者查询的主要平台，因覆盖的范围窄，电话相对较少，加之高额声讯电话费用，导致查询率较低。

　　有些防伪公司采用市话和800免费电话作为消费者查询电话，为了降低800话费支出，800免费电话的通道有限，而不拨打防伪公司的本地电话，异地消费者需要支付长途话费，许多消费者会因此放弃查询。

　　3.标识方法单一

　　除少数防伪公司实现了在生产线上直接打码外，绝大多数防伪公司只用防伪标签一种标识方法，这样使得在数量庞大、高速流水线生产、低附加值的商品上无法应用，如饮料、小袋食品、卷烟等。

　　4.机器无法识读

　　市场上能满足消费者查询的数码防伪标识，均无法进行机器识读，极大地阻碍了数码防伪技术的推广应用。